В notepad++ есть несколько способов удаления пустых строк. Один из них, самый кривой, расписан в интернете.

На картинке видно три спецсимвола: CR — возврат каретки, LF — перевод строки, FS — этот спецсимвол поставил я (ctrl+\).

При настройках по умолчанию, в notepad++ отображаются только символы типа FS. Спецсимволы перевода каретки и строки не видны, однако при этом символ FS (и не только FS) отображается вообще всегда и скрыть его нельзя. Чтобы включить отображение CR и LF нужно нажать на кнопку «отображать все символы» .

Правильный способ удаления:

Забудьте про написание регулярок, копирование спецсимволов и использование плагинов. Функция удаления пустрых строк встроена в notepad++.

Нажмите правка -> операция со строками -> удалить пустые строки

Тут-же находится удаление строк содержащие только пробелы.

Данные функции не удаляют строки содержащие символ табуляции.
В этом случае их нужно предварительно удалить:
Посик замена ->расширенный режим -> \t «заменить на» например ничего.

Рекомендую: